Det finns tre saker som jag kan tänka mig ger sådan färg:
1. järnutfällningar (har ni järnhaltigt vatten / brunnsvatten ?)
2. brunalger. De flesta alger man brukar få i pooler är gröna men det finns även bruna alger. Har kemivärdena på vattnet varit felaktiga ?
3. Står det vatten på baksidan av linern / högt grundvatten ? Om så är fallet kan detta vara starkt förorenat (gyttja, lera m.m.) och kanske tränger färgen igenom efter en tid.